Alors que les animaux vertébrés sont généralement moins sensibles, les populations d’oiseaux sont à risque par l’exposition à la consommation de semences traitées avec des insecticides systémiques et les populations de nombre d’espèces de reptiles sont connues pour s’affaiblir en raison de la régression de leurs proies tels les insectes. Les microbes (bactéries et champignons), les poissons et les amphibiens sont affectés par des concentrations élevées ou des expositions prolongées. Les échantillons prélevés dans les eaux du monde entier dépassent de manière régulière les limites écotoxicologiques.