Еще одной наиболее пострадавшей группой являются водные беспозвоночные, такие как пресноводные улитки и дафнии, подвергающиеся воздействию пестицидов через воду и потенциально через растения, они уязвимы при низких и краткосрочных дозах, влияющих на отдельные особи, на популяции и биоценоз.
Растворимость неоникотиноидов в воде (от средней до высокой степени) приводит к загрязнению поверхностных и грунтовых вод, попадая в водоемы их высокие концентрации разрушают популяцию водных насекомых и их разнообразие.
Выявленные последствия для данной группы включают в себя ухудшение кормового поведения, нарушение роста и мобильности.